افتتحت دولة قطر في نهاية عام 2005م سفارة لها في جمهورية جيبوتي، وأصبح هناك تمثيل دبلوماسي متبادل على مستوى السفراء بين البلدين.
تربط حضرة صاحب السمو الشيخ/ تميم بن حمد آل ثاني أمير البلاد المفدى - حفظه الله - علاقة خاصة بفخامة رئيس جمهورية جيبوتي السيد/ إسماعيل عمر جيله. وقد تم تبادل للزيارات بين قائدي البلدين، آخرها الزيارة التي قام بها الرئيس الجيبوتي إلى دولة قطر في فبراير 2016م،والتقى خلالها حضرة صاحب السمو أمير البلاد المفدى - حفظه الله-. هذا بالإضافة إلى تبادل العديد من الزيارات على أعلى المستويات بين الوفود الرسمية للبلدين.
تتطابق رؤية جمهورية جيبوتي مع رؤية دولة قطر ودول مجلس التعاون الخليجي تجاه قضايا المنطقة وبالأخص تجاه القضية اليمنية.
لدى دولة قطر علاقات متميزة بجمهورية جيبوتي مكنتها من القيام بوساطة لحل نزاعها الحدودي مع دولة إريتريا، ابتداء من توقيع اتفاقية الوساطة بالدوحة في شهر يونيو 2010م.وقد كللت جهود الوساطة القطرية في مارس 2016م بالإفراج عن أربعة من الأسرى الجيبوتيين المعتقلين لدى إريتريا.
دولة قطر لها مساهمة قيمة في دعم المشاريع التنموية في جيبوتي، ولها حصة من المنحة الخليجية المقدمة لجيبوتي في هذا المجال قدرها 50 مليون دولار أمريكي.
مع بداية الأزمة اليمنية في يوليو 2015م بادرت جمعية قطر الخيرية بافتتاح مكتب لها في جيبوتي للمساهمة في رفع المعاناة عن اللاجئين اليمنيين، وتقديم الدعم للحكومة الجيبوتية في هذا المجال.
بدأت الخطوط الجوية القطرية تسيير رحلات مباشرة بين الدوحة وجيبوتي، بمعدل6 رحلات أسبوعية اعتبارا من أكتوبر 2014م.
الاتفاقيات المبرمة
- مذكرة تفاهم في مجال التربية والتعليم (نوفمبر 2007م بالدوحة).
- اتفاقية للتعاون في المجال القانوني (مارس 2010م بالدوحة).
- اتفاقية بشأن تنظيم استخدام العمال الجيبوتيين في دولة قطر (أغسطس 2011م بالدوحة).
- اتفاقية تعاون في مجال النقل الجوي مارس 2012م بالدوحة).
- اتفاقية تعاون في المجال القضائي (أبريل 2012م بالدوحة).